序言

本系列是我对三年来学习Linux，R，Python，从寻找在线服务器到自己写在线服务器的过程的回忆，记录与总结，不会介绍太多生物学的背景知识，适合于对生物学有了解的读者。内容涉及：

  • 基因组注释/功能基因组学
  • 转录组/芯片数据分析
  • 蛋白质结构预测，分子对接
  • 基于结构/序列信息的蛋白质性质改造/预测
  • 简单的Python、Linux和R的介绍

我关注了不少计算和生信的教学和论坛，但是我觉得许多都偏向医学领域。目前计算生物学和生物信息学应用于极端微生物的研究，许多性能独特的酶被发现或被改造，感觉需要向工业生物技术领域的研究人员介绍计算生物学和生物信息学的使用。整个系列不侧重理论（生物学基础和软件的算法都不侧重），重点在于介绍这些方法和讨论这些方法如何应用于指导湿实验。

在此我想要感谢明灯明研究员对我的指导、帮助和关心。正是因为他的耐心培养使得这个系列有了出现的可能。